MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 109764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018143	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
2	NC_018143	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671779
3	NC_018143	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
4	NC_018143	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
5	NC_018143	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671779
6	NC_018143	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
7	NC_018143	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
8	NC_018143	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
9	NC_018143	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	397671779
10	NC_018143	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
11	NC_018143	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
12	NC_018143	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
13	NC_018143	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671779
14	NC_018143	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	397671779
15	NC_018143	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
16	NC_018143	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	397671779
17	NC_018143	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	397671779
18	NC_018143	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	397671779
19	NC_018143	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671779
20	NC_018143	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
21	NC_018143	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671779
22	NC_018143	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671779
23	NC_018143	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	397671779
24	NC_018143	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	397671779
25	NC_018143	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
26	NC_018143	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
27	NC_018143	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
28	NC_018143	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671779
29	NC_018143	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	397671779
30	NC_018143	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671779
31	NC_018143	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671779
32	NC_018143	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	397671779
33	NC_018143	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671779
34	NC_018143	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018143	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018143	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018143	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018143	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018143	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018143	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018143	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018143	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018143	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018143	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018143	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018143	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018143	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018143	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	397671780
49	NC_018143	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	397671780
50	NC_018143	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	397671780
51	NC_018143	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397671780
52	NC_018143	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
53	NC_018143	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
54	NC_018143	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
55	NC_018143	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
56	NC_018143	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
57	NC_018143	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397671780
58	NC_018143	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	397671780
59	NC_018143	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
60	NC_018143	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
61	NC_018143	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671780
62	NC_018143	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671780
63	NC_018143	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671780
64	NC_018143	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671780
65	NC_018143	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	397671780
66	NC_018143	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671780
67	NC_018143	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671780
68	NC_018143	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	397671780
69	NC_018143	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671780
70	NC_018143	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	397671780
71	NC_018143	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671780
72	NC_018143	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671780
73	NC_018143	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	397671780
74	NC_018143	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	397671780
75	NC_018143	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671780
76	NC_018143	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	397671780
77	NC_018143	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	397671781
78	NC_018143	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
79	NC_018143	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
80	NC_018143	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	397671781
81	NC_018143	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
82	NC_018143	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
83	NC_018143	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671781
84	NC_018143	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671781
85	NC_018143	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
86	NC_018143	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	397671781
87	NC_018143	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
88	NC_018143	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671781
89	NC_018143	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	397671781
90	NC_018143	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
91	NC_018143	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	397671781
92	NC_018143	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671781
93	NC_018143	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	397671781
94	NC_018143	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
95	NC_018143	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
96	NC_018143	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
97	NC_018143	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
98	NC_018143	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
99	NC_018143	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
100	NC_018143	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671781
101	NC_018143	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671781
102	NC_018143	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671781
103	NC_018143	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671781
104	NC_018143	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671781
105	NC_018143	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671781
106	NC_018143	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671782
107	NC_018143	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	397671782
108	NC_018143	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	397671782
109	NC_018143	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671782
110	NC_018143	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671782
111	NC_018143	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671782
112	NC_018143	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671782
113	NC_018143	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671782
114	NC_018143	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671782
115	NC_018143	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	397671782
116	NC_018143	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018143	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
118	NC_018143	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
119	NC_018143	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
120	NC_018143	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671783
121	NC_018143	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
122	NC_018143	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
123	NC_018143	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
124	NC_018143	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
125	NC_018143	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
126	NC_018143	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	397671783
127	NC_018143	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	397671783
128	NC_018143	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
129	NC_018143	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
130	NC_018143	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
131	NC_018143	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397671783
132	NC_018143	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
133	NC_018143	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	397671783
134	NC_018143	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671783
135	NC_018143	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	397671783
136	NC_018143	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671783
137	NC_018143	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
138	NC_018143	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
139	NC_018143	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
140	NC_018143	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
141	NC_018143	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
142	NC_018143	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	397671783
143	NC_018143	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671783
144	NC_018143	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397671783
145	NC_018143	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397671783
146	NC_018143	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671783
147	NC_018143	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	397671783
148	NC_018143	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671783
149	NC_018143	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	397671783
150	NC_018143	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671783
151	NC_018143	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
152	NC_018143	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671783
153	NC_018143	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671783
154	NC_018143	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671783
155	NC_018143	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671783
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159	NC_018143	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	397671783
160	NC_018143	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671783
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164	NC_018143	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	397671784
165	NC_018143	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671784
166	NC_018143	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
167	NC_018143	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	397671784
168	NC_018143	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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170	NC_018143	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	397671784
171	NC_018143	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671784
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173	NC_018143	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671784
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192	NC_018143	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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204	NC_018143	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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225	NC_018143	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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230	NC_018143	GAA	2	6	9759	9764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671784
231	NC_018143	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671784
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233	NC_018143	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_018143	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_018143	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671785
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239	NC_018143	CCG	4	12	10137	10148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671785
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242	NC_018143	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	397671785
243	NC_018143	GCC	2	6	10385	10390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671785
244	NC_018143	GCG	2	6	10398	10403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671785
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247	NC_018143	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671785
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255	NC_018143	CGG	2	6	10792	10797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671785
256	NC_018143	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_018143	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_018143	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_018143	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_018143	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_018143	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_018143	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_018143	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_018143	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_018143	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671786
266	NC_018143	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671786
267	NC_018143	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_018143	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	397671787
269	NC_018143	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671787
270	NC_018143	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_018143	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_018143	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_018143	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018143	GGT	2	6	11902	11907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671788
275	NC_018143	CGA	2	6	11928	11933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671788
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277	NC_018143	GCC	2	6	11977	11982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671788
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279	NC_018143	TGC	2	6	12014	12019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671788
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286	NC_018143	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_018143	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_018143	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
289	NC_018143	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671789
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295	NC_018143	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671790
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297	NC_018143	GGC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671790
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302	NC_018143	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	397671790
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305	NC_018143	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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307	NC_018143	CGG	2	6	13702	13707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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344	NC_018143	CAG	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671793
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391	NC_018143	GGT	2	6	17462	17467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671794
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